水下钻孔当孔深及孔径较小或在竖直面上钻孔时，可用风动凿岩机钻孔，由潜水员在水下直接操作。当在闸坝上游进行帷幕补强灌浆或钻大孔径爆破孔时，一般采用设在船台或浮排组成的工作台上的回转钻机钻孔。20世纪60年代以来，欧洲、美洲一些国家和日本广泛采用了双套管（其外套管用以固定钻孔位置，保护钻具免受流水冲击；内套管头部镶有环形钻头，可以钻透覆盖层达到基岩中）在深水域钻孔。